A Diocese de Bauru foi criada pelo Papa São Paulo VI, mediante a Bula “Christi Gregis”, de 15 de fevereiro de 1964. A Diocese é constituída de território desmembrado da Arquidiocese de Botucatu e da Diocese de Lins. Situada na região Centro-Oeste do Estado de São Paulo, limita-se com a Arquidiocese de Botucatu e com as Dioceses de Assis, Lins, Marília e São Carlos.
A instalação definitiva se deu no dia 17 de maio de 1964, quando tomou posse seu primeiro bispo, D. Vicente Ângelo José Marchetti Zione. Naquele momento, a Diocese possuía 5.845 km², 12 municípios e 18 paróquias. Sua população somava 251.065 habitantes. A Arquidiocese de Botucatu cedeu as cidades de Agudos, Bauru, Boracéia, Cabrália Paulista, Duartina, Gália, Lucianópolis, Pederneiras e Piratininga, enquanto a Diocese de Lins cedeu Arealva, Avaí e Iacanga para a formação da nova Igreja Particular, como também é chamada cada diocese católica.
O segundo bispo diocesano, D. Cândido Padin, OSB governou de 2 de agosto de 1970 a 4 de setembro de 90, sucedido, por D. Aloysio José Leal Penna, SJ.
O terceiro bispo de Bauru, D. Aloysio José Leal Penna, SJ, iniciou seus trabalhos em 4 de setembro de 1990. Em junho do ano 2000, D. Aloysio deixa a Diocese de Bauru para assumir o governo da Arquidiocese de Botucatu. A partir de 29 de agosto de 2000, a administração da Diocese ficou sob a responsabilidade de Padre Enedir Gonçalves Moreira, pároco da Paróquia Universitária do Sagrado Coração de Jesus e designado para a função de administrador diocesano, a partir da eleição realizada pelo Colégio de Consultores da Diocese.
Em 24 de outubro de 2001, o Papa João Paulo II nomeia D. Luiz Antônio Guedes como quarto bispo da Diocese de Bauru. Sua posse foi celebrada no dia 23 de dezembro de 2001. Em setembro de 2008, D. Luiz Antônio foi transferido para governar a Diocese de Campo Limpo, São Paulo Capital. No período Vacante a Diocese de Bauru foi administrada pelo padre Luiz Eduardo Monteiro Fontana, eleito pelo Colégio de Consultores.
No dia 31 de maio de 2009 D. Frei Caetano Ferrari, OFM tomou posse como quinto bispo da Diocese de Bauru, em cerimônia na Catedral do Divino Espírito Santo, durante a Festa de Pentecostes. Exerceu o seu ministério pastoral até 28 de março de 2018, quando a Santa Sé aceito seu pedido de renúncia e tornou-se Bispo emérito. Na mesma nomeação foi investido como administrador apostólico até a posse de seu sucessor, D. Rubens Sevilha, OCD, anunciado como sexto bispo da diocese na mesma data de 28 de março de 2018.
No dia 20 de maio de 2018, nomeado pelo Papa Francisco, Dom Rubens Sevilha, OCD tomou posse do governo da Diocese de Bauru, em cerimônia canônica na Catedral do Divino Espírito Santo, na Solenidade de Pentecostes, sendo esta precedida por cerimônia civil de acolhimento do novo bispo pelas autoridades de algumas cidades pertencentes a esta Igreja Particular do Divino Espírito Santo em Bauru.
População:

Paróquias: 42
Divisão Territorial na Cidade de Agudos/SP:
Divisão Territorial na cidade de Bauru/SP: BAURU_PARÓQUIAS
Divisão Territorial na Cidade de Pederneiras/SP:
Regiões Pastorais:
Região Pastoral 1
01. Catedral do Divino Espírito Santo (Bauru)
02. Santuário Nossa Senhora Aparecida (Bauru)
03. São Cristóvão (Bauru)
04. São Judas Tadeu e São Dimas (Bauru)
05. Santa Rita de Cássia (Bauru)
06. Santa Teresinha do Menino Jesus (Bauru)
Região Pastoral 2
07. São José de Anchieta (Bauru)
08. Nossa Senhora das Graças (Bauru)
09. São Brás (Bauru)
10. Santa Edviges (Bauru)
11. Santa Luzia (Bauru)
12. São Paulo Apóstolo (Bauru)
Região Pastoral 3
13. Maria Mãe do Redentor (Bauru)
14. Imaculada Conceição (Bauru)
15. Maria de Nazaré (Bauru)
16. Sagrado Coração de Jesus (Bauru)
17. Sagrada Família (Bauru)
18. São Sebastião (Bauru)
19. Nossa Senhora Aparecida (Agudos)
20. Santo Antônio (Agudos)
21. São Paulo Apóstolo (Agudos)
Região Pastoral 4
22. Santo Antônio (Bauru)
23. São Benedito (Bauru)
24. Santa Clara de Assis (Bauru)
25. São José Trabalhador (Bauru)
26. São Pedro Apóstolo (Bauru)
Região Pastoral 5
27. Nossa Senhora da Assunção (Bauru)
28. Senhor Bom Jesus (Bauru)
29. São João Batista e Nossa Senhora de Lourdes (Bauru)
30. Santa Maria (Piratininga)
Região Pastoral 6
31. São Sebastião (Avaí)
32. Senhor Bom Jesus do Mirante (Cabrália Paulista)
33. Santa Luzia (Duartina)
34. São José (Gália)
35. São Pedro Apóstolo (Lucianópolis)
36. Santa Teresinha (Paulistânia)
Região Pastoral 7
37. Nossa Senhora Aparecida (Boracéia)
38. Nossa Senhora Aparecida (Pederneiras)
39. São Judas Tadeu (Pederneiras)
40. São Sebastião (Pederneiras)
41. Santa Catarina de Alexandria (Arealva)
42. São João Batista (Iacanga)
Superfície: 5.887 km² (Diocese)
Municípios: 14 = Agudos, Arealva, Avaí, Bauru, Boracéia, Cabrália Paulista, Duartina, Fernão, Gália, Iacanga, Lucianópolis, Paulistânia, Pederneiras e Piratininga.
Distritos: 6 = Jacuba (Município de Arealva), Tibiriçá (Município de Bauru), Domélia (Município de Paulistânia), Santelmo, Vanglória e Guaianas (Município de Pederneiras).